24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1583 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  100 
 
 		 147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  57.97 
 
 		 148 aa  170  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  56.93 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  34.26 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  34.34 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  39.18 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1031  hypothetical protein  37.4 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  35.19 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1397  hypothetical protein  33.9 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.737899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3196  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1273  hypothetical protein  31.36 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  32.43 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0332  Protein of unknown function CGGC region  29.82 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.19999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  30.56 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  31.53 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  30.3 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  29.63 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  31 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  34.33 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  29.91 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0443  hypothetical protein  25.45 
 
 		 107 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0452  hypothetical protein  25.45 
 
 		 107 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>