20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2128 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  70.91 
 
 
110 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  66.97 
 
 
109 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  69.72 
 
 
109 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  68.81 
 
 
109 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  66.06 
 
 
109 aa  159  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  131  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  51.82 
 
 
110 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  30.85 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  30.56 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  30.19 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  34.67 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  31.43 
 
 
148 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  25.26 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  32.43 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1554  hypothetical protein  27.19 
 
 
137 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  27.19 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0332  Protein of unknown function CGGC region  26.89 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.19999e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>