20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3511 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  88.07 
 
 		 109 aa  201  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  86.24 
 
 		 109 aa  199  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  77.06 
 
 		 109 aa  184  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  75.23 
 
 		 110 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  69.72 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  60 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  57.27 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  53.64 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  31.53 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  35.42 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  30.21 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  31.53 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  34.25 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  32.38 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  30.48 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  29.29 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  30.36 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>