40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0180 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  36.71 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  31.6 
 
 
215 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4509  protein of unknown function DUF1648  37.5 
 
 
221 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.193955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  38.66 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  38.14 
 
 
212 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  33.86 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  34.03 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  37.13 
 
 
211 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  37.2 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0626  protein of unknown function DUF1648  35.38 
 
 
214 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  34.33 
 
 
211 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  35.08 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0037  protein of unknown function DUF1648  36.6 
 
 
232 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2854  protein of unknown function DUF1648  34.62 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1033  hypothetical protein  32.08 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1248  hypothetical protein  31.28 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02760  predicted integral membrane protein  31.73 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  32.32 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2918  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1942  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1061  hypothetical protein  31.58 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0330  integral membrane protein  32.84 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2891  protein of unknown function DUF1648  29.81 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4023  protein of unknown function DUF1648  29.8 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4958  hypothetical protein  31.09 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2299  protein of unknown function DUF1648  29.86 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.516258  decreased coverage  0.000180045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1930  hypothetical protein  31.63 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6870  protein of unknown function DUF1648  29.53 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401188  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  26.44 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  25 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  25.6 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0124  protein of unknown function DUF1648  26 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1696  hypothetical protein  24.37 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000273013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2759  protein of unknown function DUF1648  31.88 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3393  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3146  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.559851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3133  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.85877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31760  hypothetical protein  31.71 
 
 
130 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3368  hypothetical protein  35.59 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>