24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1696 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1696  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000273013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  34.29 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  32.05 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  32.99 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  30.61 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  32.99 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  31.96 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  37.5 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  37.29 
 
 
211 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  35 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02760  predicted integral membrane protein  39.71 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  31.25 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0037  protein of unknown function DUF1648  34.48 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  28.32 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2299  protein of unknown function DUF1648  36.25 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.516258  decreased coverage  0.000180045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2854  protein of unknown function DUF1648  24.24 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1942  hypothetical protein  27.52 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2891  protein of unknown function DUF1648  24.05 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  26.44 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0124  protein of unknown function DUF1648  26.47 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0626  protein of unknown function DUF1648  20.9 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>