36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1248 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1248  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1033  hypothetical protein  89.55 
 
 
221 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1061  hypothetical protein  87.73 
 
 
221 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2854  protein of unknown function DUF1648  45.45 
 
 
226 aa  187  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  37.44 
 
 
223 aa  154  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2918  hypothetical protein  42.08 
 
 
230 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  33.8 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  37.44 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  37.44 
 
 
212 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4509  protein of unknown function DUF1648  36.51 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.193955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  34.76 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  36.45 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  34.29 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  34.29 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0626  protein of unknown function DUF1648  35.58 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  34.41 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1942  hypothetical protein  33.49 
 
 
219 aa  121  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0037  protein of unknown function DUF1648  37.5 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02760  predicted integral membrane protein  34.45 
 
 
222 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1930  hypothetical protein  37.07 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  30.54 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  32.28 
 
 
217 aa  89  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2299  protein of unknown function DUF1648  31.53 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.516258  decreased coverage  0.000180045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4958  hypothetical protein  28.85 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2891  protein of unknown function DUF1648  29.19 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0330  integral membrane protein  33.73 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0124  protein of unknown function DUF1648  25.93 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4023  protein of unknown function DUF1648  28.22 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919179  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  28.8 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6870  protein of unknown function DUF1648  29.41 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401188  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  30.46 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  25.38 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10280  Protein of unknown function (DUF1648)  36.84 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.847558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1185  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1406  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.498554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>