35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1033 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1248  hypothetical protein  89.55 
 
 		 221 aa  401  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1061  hypothetical protein  91.86 
 
 		 221 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2854  protein of unknown function DUF1648  43.54 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  39.22 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2918  hypothetical protein  42.29 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  38.39 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  38.39 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  36.92 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  32.72 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  35.24 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  34.76 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  34.29 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4509  protein of unknown function DUF1648  37.04 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.193955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0626  protein of unknown function DUF1648  32.69 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  33.7 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0037  protein of unknown function DUF1648  39.58 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1942  hypothetical protein  34.62 
 
 		 219 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1930  hypothetical protein  35.29 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02760  predicted integral membrane protein  32.54 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  32.63 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  30.54 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4958  hypothetical protein  28.85 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2891  protein of unknown function DUF1648  28.43 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2299  protein of unknown function DUF1648  29.56 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.516258  decreased coverage  0.000180045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0124  protein of unknown function DUF1648  25.46 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4023  protein of unknown function DUF1648  29.52 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0330  integral membrane protein  35.12 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6870  protein of unknown function DUF1648  30.05 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401188  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  27 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  28.14 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  25.96 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10280  Protein of unknown function (DUF1648)  38.46 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.847558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1313  hypothetical protein  30.19 
 
 		 404 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>