36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2299 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2299  protein of unknown function DUF1648  100 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.516258  decreased coverage  0.000180045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4959  conserved membrane protein YvaZ  34.7 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4987  hypothetical protein  31.31 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4974  conserved membrane protein YvaZ  31.31 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0275  conserved membrane protein YvaZ  31.51 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4675  hypothetical protein  32.64 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4585  hypothetical protein  32.12 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4509  protein of unknown function DUF1648  33.68 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.193955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0745  hypothetical protein  31.5 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0849959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0626  protein of unknown function DUF1648  31.96 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2972  protein of unknown function DUF1648  31.84 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1248  hypothetical protein  32.84 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1033  hypothetical protein  30.1 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4958  hypothetical protein  32.32 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2918  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1061  hypothetical protein  30.41 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2854  protein of unknown function DUF1648  31.63 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1930  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2085  hypothetical protein  29.95 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02760  predicted integral membrane protein  27.98 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6870  protein of unknown function DUF1648  27.19 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.401188  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2273  hypothetical protein  25.89 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1303  protein of unknown function DUF1648  28.43 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0037  protein of unknown function DUF1648  30.85 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1942  hypothetical protein  32.09 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2891  protein of unknown function DUF1648  33.82 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0304  hypothetical protein  27.52 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4023  protein of unknown function DUF1648  28.77 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0919179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0330  integral membrane protein  29.67 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1294  protein of unknown function DUF1648  28.12 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.65227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0180  hypothetical protein  29.17 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0124  protein of unknown function DUF1648  27.94 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1696  hypothetical protein  35 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000273013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3397  hypothetical protein  22.22 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0157926  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2484  hypothetical protein  20.44 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.140887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1401  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00291068  normal  0.0567328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>