17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2570 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2570  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 
241 aa  465  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0752295  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2271  hypothetical protein  40.45 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.24 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  23.88 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  26.19 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0334  Flp pilus assembly CpaB  26.19 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  22.6 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  30.1 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  30.67 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  30.83 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  28.8 
 
 
357 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  28.46 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  30.56 
 
 
332 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  33.98 
 
 
323 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  33.98 
 
 
323 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  38.46 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  23.36 
 
 
295 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>