287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0642 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0535  flavodoxin family protein  51.64 
 
 
218 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0519  putative acyl carrier protein phosphodiesterase 1  51.64 
 
 
218 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.95 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  31.58 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
210 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
210 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  30.48 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  30.48 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  35.55 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.02 
 
 
198 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  27.59 
 
 
211 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  26.76 
 
 
211 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  26.76 
 
 
211 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  26.29 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  26.29 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  26.76 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  26.76 
 
 
211 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  26.29 
 
 
211 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  26.29 
 
 
211 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  26.29 
 
 
211 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  25.35 
 
 
211 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0988  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  25.12 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  25.12 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  25.12 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0927  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  24.4 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  24.64 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  26.94 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  24.64 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  24.64 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  25.12 
 
 
230 aa  88.2  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  24.64 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  24.64 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  25.91 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  25.91 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  25.91 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  25.39 
 
 
208 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0427  Acyl carrier protein phosphodiesterase  29.41 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.319944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.12 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.21 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.39 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  25.93 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.52 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  25.12 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  25.12 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.11 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  24.3 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  24.65 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.87 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.36 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.07 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  23.3 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  28.36 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.36 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.49 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.47 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  23.36 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  22.33 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3584  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.04 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000358393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.62 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.73 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.9 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  26.15 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.67 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  26.24 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  21.34 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  25.79 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  23.86 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.38 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  23.86 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.46 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.1 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.56 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  24.37 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.96 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.07 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.53 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  24.29 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.05 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.56 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.66 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  25.13 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.67 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  25.13 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  26.89 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  24.64 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.48 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  24.62 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.22 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  28.66 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>