17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4349 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4349  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 334 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1082 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 		 1087 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  30.71 
 
 		 807 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  26.88 
 
 		 1180 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.42 
 
 		 1611 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.32 
 
 		 2145 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 		 632 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.69 
 
 		 782 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1550 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1519 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 817 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1123 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1025 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  19.88 
 
 		 1238 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1215 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1119 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>