More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1604 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1604  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0688  integral membrane protein TerC  63.13 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2846  integral membrane protein TerC  53.3 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0648136 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8206  Integral membrane protein TerC  59.61 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3975  integral membrane protein TerC  62.56 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1799  Integral membrane protein TerC  60 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.099096  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4666  Integral membrane protein TerC  65.8 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1409  integral membrane protein TerC  61.54 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.207515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1987  Integral membrane protein TerC  59.13 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417869  hitchhiker  0.00928883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1430  integral membrane protein TerC  61.5 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1799  integral membrane protein TerC  62.31 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.916732  decreased coverage  0.000172581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1152  integral membrane protein TerC  58.05 
 
 		 213 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2839  integral membrane protein TerC  54.63 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3428  Integral membrane protein TerC  51.02 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3018  integral membrane protein TerC  53.48 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  36.46 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  36.84 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  34.9 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  34.89 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  34.55 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  36.13 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  38.54 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  37.24 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  34.67 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  34.67 
 
 		 227 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  33.85 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  33.03 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  36.65 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  38.02 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  32.57 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  38.74 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  32.57 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  38.22 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  32.57 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  32.57 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  32.57 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  32.11 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  38.02 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  31.03 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  32.11 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  32.11 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  34.9 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  31.19 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  33.17 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  38.02 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  33.66 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  35.94 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  35.59 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  35.59 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  35.59 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  32.28 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  35.03 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  35.03 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  35.03 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  35.03 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  35.03 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  36.98 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  36.46 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  30.69 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  32.63 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  32.64 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  32.16 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  34.38 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  36.11 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  32.22 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  32.29 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  32.29 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  34.2 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  35.42 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  35 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  31.52 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  26.81 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  31.96 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  33.16 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  35.86 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  34.55 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  32.64 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  26.58 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  33.16 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  32.77 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  28.14 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  31.61 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  26.52 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  24.68 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  24.89 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  33.33 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  26.52 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  25.24 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4409  Integral membrane protein TerC  28.57 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  25.34 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>