289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1152 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1152  integral membrane protein TerC  100 
 
 
213 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1799  Integral membrane protein TerC  69.9 
 
 
201 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.099096  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1987  Integral membrane protein TerC  68.93 
 
 
208 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417869  hitchhiker  0.00928883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1799  integral membrane protein TerC  72.2 
 
 
212 aa  248  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.916732  decreased coverage  0.000172581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0688  integral membrane protein TerC  67.13 
 
 
217 aa  244  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8206  Integral membrane protein TerC  65.71 
 
 
227 aa  230  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3975  integral membrane protein TerC  64.59 
 
 
220 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1430  integral membrane protein TerC  64.88 
 
 
216 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4666  Integral membrane protein TerC  66.5 
 
 
211 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1409  integral membrane protein TerC  64.56 
 
 
220 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.207515  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2846  integral membrane protein TerC  54.08 
 
 
240 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0648136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1604  integral membrane protein TerC  58.33 
 
 
246 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3428  Integral membrane protein TerC  52.82 
 
 
207 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450172  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3018  integral membrane protein TerC  51.67 
 
 
212 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2839  integral membrane protein TerC  57.64 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  37.36 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
249 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  36.08 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  33.5 
 
 
229 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  37.06 
 
 
230 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  36.04 
 
 
230 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  37.25 
 
 
246 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  37 
 
 
231 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  34.85 
 
 
233 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  36.82 
 
 
233 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  37.06 
 
 
230 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  36.32 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  36.32 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  36.51 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  37.16 
 
 
239 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  36.84 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  38.89 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  36.32 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  38.38 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  38.38 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  38.38 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  35.51 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  38.38 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  38.38 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  38.38 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  38.07 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  39.23 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  34.54 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  38.38 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  36.32 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  34.54 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  38.38 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  38.38 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  37.88 
 
 
224 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  34.01 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  36.92 
 
 
223 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  39.25 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  36.87 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  36.55 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  33.16 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  36.45 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  40.68 
 
 
221 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  37.44 
 
 
251 aa  91.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  36.51 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  34.11 
 
 
247 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
270 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
270 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  38.42 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  36.41 
 
 
237 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  38.59 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  34.88 
 
 
249 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  36.68 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  35.38 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  35.29 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  34.15 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  36 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  31.98 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  36.57 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  30.19 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  37.04 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  32.8 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  34.24 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  35.21 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  35.87 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  35.87 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  35.87 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  35.75 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  35.03 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  35.23 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  34.48 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  36.41 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  33.01 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  35.21 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>