17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6931 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6931  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103363  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01690  predicted Zn peptidase  37.14 
 
 		 246 aa  91.3  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4018  hypothetical protein  29.28 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  31.75 
 
 		 349 aa  51.6  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.83 
 
 		 395 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  28.74 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0222  protein of unknown function DUF955  28.95 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  25.13 
 
 		 272 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  30.26 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  27.96 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  30.63 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  29.09 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  27.78 
 
 		 388 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.16 
 
 		 372 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.86 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>