26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5653 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5653  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218337  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31050  hypothetical protein  43.75 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00870089  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5884  hypothetical protein  36.57 
 
 
235 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4408  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  28.69 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  28.28 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2719  hypothetical protein  25.64 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.5 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  27.39 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  27.39 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  26.56 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  22.44 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  28.49 
 
 
234 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  27.59 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  30.25 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  27.68 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3083  hypothetical protein  29.81 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  25.4 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  26.7 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  30.88 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  30.89 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>