25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0748 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  63.18 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  63.92 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  55.68 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  59.27 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.51 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  61.73 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  57.09 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  54.21 
 
 		 273 aa  285  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  55.04 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.72 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.72 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.72 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  52.65 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.92 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  51.29 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  54.24 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  55.17 
 
 		 270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  54.65 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  54.98 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  54.18 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  53.1 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  45.35 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  44.57 
 
 		 250 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  40 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>