25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1866 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  63.57 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  57.63 
 
 
261 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  61.73 
 
 
274 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  55.81 
 
 
266 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  55.4 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  54.14 
 
 
261 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  55.96 
 
 
270 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  52.75 
 
 
266 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  53.15 
 
 
272 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  53.54 
 
 
272 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  52.49 
 
 
273 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  54.05 
 
 
274 aa  261  6e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  53.21 
 
 
273 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  53.82 
 
 
280 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  54.15 
 
 
269 aa  254  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  54.02 
 
 
273 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  47.76 
 
 
270 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  50.54 
 
 
272 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  50.54 
 
 
272 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  50.54 
 
 
272 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  53.85 
 
 
253 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  45.63 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  45.21 
 
 
250 aa  178  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  39.67 
 
 
232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>