25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3925 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  60.44 
 
 
273 aa  341  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  60.64 
 
 
280 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  62.36 
 
 
272 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  62.36 
 
 
272 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  62.36 
 
 
272 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  60.31 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  59.93 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  59 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  58.24 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  55.02 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  53.33 
 
 
272 aa  285  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  53.33 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  55.08 
 
 
261 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  59.14 
 
 
253 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  50.37 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  51.29 
 
 
274 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  50 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  52.67 
 
 
277 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  48.43 
 
 
266 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  47.92 
 
 
261 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  47.76 
 
 
275 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  42.75 
 
 
259 aa  175  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  42.86 
 
 
250 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  37.5 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>