25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5517 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  56.98 
 
 
266 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  54.85 
 
 
266 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  56.18 
 
 
261 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  55.56 
 
 
280 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  52.63 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  50.37 
 
 
270 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  54.44 
 
 
273 aa  284  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  54.86 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  52.36 
 
 
269 aa  279  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  53.76 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  55.17 
 
 
274 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  52.69 
 
 
272 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  52.69 
 
 
272 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  53.61 
 
 
277 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  52.69 
 
 
272 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  48.51 
 
 
274 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  49.64 
 
 
272 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  49.64 
 
 
272 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  53.79 
 
 
261 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  55.96 
 
 
275 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  52.9 
 
 
253 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  43.12 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  45.1 
 
 
250 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  40.25 
 
 
232 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>