25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0010 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  51.09 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  45.25 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  41.98 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  39.59 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  39.59 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  38.52 
 
 		 274 aa  141  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  39.63 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  37.45 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  36.44 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  40.25 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  40.64 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  39.07 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  39.64 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  40.42 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  42.34 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  42.01 
 
 		 253 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  42.26 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  41.67 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  39.27 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  39.27 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  39.27 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  37.04 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  40.33 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>