25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1115 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1115  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  547  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0287  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  64.45 
 
 
273 aa  341  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0393  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  64.45 
 
 
273 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0497469  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27760  hypothetical protein  60.31 
 
 
280 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0429463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3566  integral membrane protein  62.64 
 
 
269 aa  318  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10252  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  59.38 
 
 
273 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0864804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2213  putative integral membrane protein  59 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0254  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  61 
 
 
272 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0244  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  61 
 
 
272 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0264  putative succinate dehydrogenase (membrane anchor subunit) (succinic dehydrogenase)  61 
 
 
272 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3925  hypothetical protein  55.02 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3767  hypothetical protein  55.02 
 
 
272 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.184218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4149  hypothetical protein  55.42 
 
 
272 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724441  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1425  putative integral membrane protein  61.72 
 
 
253 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4025  hypothetical protein  54.34 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377584  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5517  hypothetical protein  54.85 
 
 
270 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1798  integral membrane protein  53.85 
 
 
276 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0916244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3049  putative integral membrane protein  51.27 
 
 
266 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3549  integral membrane protein  50.9 
 
 
277 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0748  integral membrane protein  52.65 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8463  putative integral membrane protein  49.81 
 
 
261 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1866  hypothetical protein  52.75 
 
 
275 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1383  putative integral membrane protein  40 
 
 
259 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2529  hypothetical protein  44.05 
 
 
250 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.225831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0010  integral membrane protein  40.64 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>