22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1532 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1532  accessory gene regulator protein B, putative  100 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1813  putative accessory gene regulator protein B  92.99 
 
 		 214 aa  360  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01610  Accessory gene regulator B  30.81 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0386  Accessory gene regulator B  25.6 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0915  Accessory gene regulator B  28.38 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1580  accessory gene regulator B  26.7 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406273  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1290  accessory gene regulator B  25.13 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3687  Accessory gene regulator B  29.73 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1310  accessory gene regulator B  27.03 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1620  accessory gene regulator B  25.35 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0909  accessory gene regulator B  27.75 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.291264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3428  Accessory gene regulator B  23.41 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2623  Accessory gene regulator B  28.97 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0955  Accessory gene regulator B  20.83 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2358  accessory gene regulator B  23.53 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000360105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0905  accessory gene regulator B  23.96 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.491294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0446  hypothetical protein  25.53 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2798  Accessory gene regulator B  18.99 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000819807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0865  AgrB family protein  28.99 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.017781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3199  Accessory gene regulator B  25.59 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0400  hypothetical protein  35.06 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2127  Accessory gene regulator B  27.45 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0523573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>