21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1813 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1813  putative accessory gene regulator protein B  100 
 
 		 214 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1532  accessory gene regulator protein B, putative  92.99 
 
 		 214 aa  334  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01610  Accessory gene regulator B  31.4 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0386  Accessory gene regulator B  28.91 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1580  accessory gene regulator B  27.27 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406273  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1290  accessory gene regulator B  25.63 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0915  Accessory gene regulator B  27.94 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3687  Accessory gene regulator B  26.53 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3428  Accessory gene regulator B  25.37 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1310  accessory gene regulator B  26.35 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0909  accessory gene regulator B  27.23 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.291264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0955  Accessory gene regulator B  21.43 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1620  accessory gene regulator B  23.26 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2623  Accessory gene regulator B  29.73 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2358  accessory gene regulator B  25.82 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000360105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2798  Accessory gene regulator B  21.56 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000819807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0905  accessory gene regulator B  23.64 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.491294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0865  AgrB family protein  27.54 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.017781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0446  hypothetical protein  26.14 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0400  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2127  Accessory gene regulator B  29.68 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0523573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>