20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1310 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1310  accessory gene regulator B  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2127  Accessory gene regulator B  38.46 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0523573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0386  Accessory gene regulator B  30.28 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2358  accessory gene regulator B  26.23 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000360105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01610  Accessory gene regulator B  23.76 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1580  accessory gene regulator B  25.82 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406273  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3687  Accessory gene regulator B  27.07 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0915  Accessory gene regulator B  25.5 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1813  putative accessory gene regulator protein B  25.19 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1532  accessory gene regulator protein B, putative  30.95 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2623  Accessory gene regulator B  25.52 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2798  Accessory gene regulator B  26.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000819807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1620  accessory gene regulator B  26.11 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0909  accessory gene regulator B  25.77 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.291264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0955  Accessory gene regulator B  28.87 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0400  hypothetical protein  26.21 
 
 		 102 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2110  accessory gene regulator B  24.82 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2073  accessory gene regulator B  24.82 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.122741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0446  hypothetical protein  25.48 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1290  accessory gene regulator B  22.4 
 
 		 212 aa  42  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>