19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2358 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2358  accessory gene regulator B  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000360105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0955  Accessory gene regulator B  43.63 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2798  Accessory gene regulator B  41.18 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000819807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01610  Accessory gene regulator B  33.16 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3199  Accessory gene regulator B  27.72 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3687  Accessory gene regulator B  30.41 
 
 
161 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2623  Accessory gene regulator B  27.71 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1290  accessory gene regulator B  24.1 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0386  Accessory gene regulator B  24.12 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0915  Accessory gene regulator B  25.93 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1310  accessory gene regulator B  26.23 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1620  accessory gene regulator B  23.44 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1580  accessory gene regulator B  25.3 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406273  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0865  AgrB family protein  29.63 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.017781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0909  accessory gene regulator B  25.37 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.291264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0400  hypothetical protein  33.72 
 
 
102 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3079  Accessory gene regulator B  24.23 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000646617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0905  accessory gene regulator B  24.5 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.491294  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1813  putative accessory gene regulator protein B  25.95 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>