121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1900 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  100 
 
 		 509 aa  996    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000710979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  99.02 
 
 		 509 aa  992    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2480  stage V sporulation protein B  45.59 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  31.28 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  25.21 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000392741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  24.08 
 
 		 512 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  23.03 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 539 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  27.13 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 517 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  23.93 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  24.29 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  24.06 
 
 		 519 aa  143  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  20.83 
 
 		 516 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  23.82 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0815  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0992616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  23.51 
 
 		 520 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  23.48 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 535 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1564  polysaccharide biosynthesis protein  20.52 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  21.89 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 506 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  21.89 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  21.62 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  21.35 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  21.35 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  21.35 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  21.35 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  22.12 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  22.12 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  21.35 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  22.87 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  22.87 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  21.18 
 
 		 544 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.87 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.87 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  21.64 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  21.35 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  20.59 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.91 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.45 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.47 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  23.04 
 
 		 647 aa  75.1  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  22.92 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  22.06 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 550 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  21.81 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  21.63 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  20.47 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  20.47 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  20.47 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  20.47 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  20.61 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  20.47 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  23.62 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  20.47 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  21.51 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  19.9 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>