122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1619 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  99.02 
 
 
509 aa  992    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000710979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  100 
 
 
509 aa  996    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2480  stage V sporulation protein B  45.59 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  31.5 
 
 
522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0529  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 
518 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  25.21 
 
 
529 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
522 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  28.85 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000392741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  24.3 
 
 
512 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  23.03 
 
 
513 aa  154  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
539 aa  153  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  27.13 
 
 
517 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  23.93 
 
 
517 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  24.29 
 
 
519 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  24.06 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 
519 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  23.82 
 
 
519 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  23.58 
 
 
519 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  20.83 
 
 
516 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 
526 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  23.82 
 
 
519 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0815  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 
495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0992616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  23.31 
 
 
520 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 
514 aa  123  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.45 
 
 
510 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  22.86 
 
 
520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
535 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 
538 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  23.7 
 
 
544 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  22.37 
 
 
538 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
535 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1564  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  22.16 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  22.16 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  21.89 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  21.62 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  21.62 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  21.62 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  21.62 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  22.42 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  22.42 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 
542 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 
544 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 
544 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  21.18 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  21.18 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  23.02 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  21.64 
 
 
544 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  21.35 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  20.59 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  22.83 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.83 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  22.83 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 
544 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.23 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
564 aa  77  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  23.42 
 
 
506 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
519 aa  77  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.47 
 
 
506 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
506 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 
541 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  23.04 
 
 
647 aa  74.3  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  22.98 
 
 
552 aa  70.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  22.06 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 
550 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
514 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
549 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  21.63 
 
 
550 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 
550 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  21.45 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 
513 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  20.61 
 
 
550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  20.47 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  20.47 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  20.61 
 
 
550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  20.47 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  20.47 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  20.61 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  23.62 
 
 
543 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
508 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
508 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 
529 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1986  hypothetical protein  25 
 
 
557 aa  57.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  21.12 
 
 
527 aa  57.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>