32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0332 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  263  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  48.84 
 
 
129 aa  123  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2131  hypothetical protein  50.85 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0738021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  42.5 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  45.08 
 
 
130 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0253  hypothetical protein  47.83 
 
 
122 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000900018  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1712  hypothetical protein  46.77 
 
 
124 aa  107  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.20509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1216  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00354732  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  41.53 
 
 
128 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  49.45 
 
 
91 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2639  Protein of unknown function DUF2089  38.76 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0317  hypothetical protein  39.66 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000156434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  44.54 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2023  hypothetical protein  44.68 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  39.34 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4061  hypothetical protein  33.9 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0737  hypothetical protein  44.54 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  34.68 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3353  hypothetical protein  33.05 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3223  hypothetical protein  31.09 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00178123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2433  hypothetical protein  33.9 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204851  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  36.13 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  40.21 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  32.74 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0120  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000405426  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1885  transcriptional regulator, Fis family  30.51 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000161722  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  30.25 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0580  hypothetical protein  29.63 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.440494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0595  uncharacterized protein-like protein  29.63 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000255916  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0500  hypothetical protein  46.43 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.158797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0863  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1605  hypothetical protein  43.18 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.955331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>