29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0563 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  7e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  92.74 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  88.71 
 
 		 124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2131  hypothetical protein  41.12 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0738021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  43.16 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0253  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000900018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  34.43 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  36.97 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  36.13 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0317  hypothetical protein  35.78 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000156434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  31.53 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1712  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.20509  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1885  transcriptional regulator, Fis family  34.82 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000161722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1216  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00354732  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0737  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3223  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00178123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  32.73 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2023  hypothetical protein  34.62 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  39.06 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2433  hypothetical protein  36.28 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2639  Protein of unknown function DUF2089  34.02 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4061  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3353  hypothetical protein  32.73 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0500  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.158797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0595  uncharacterized protein-like protein  24.32 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000255916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0580  hypothetical protein  24.32 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.440494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>