29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3223 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3223  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  237  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00178123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4061  hypothetical protein  62.18 
 
 
120 aa  146  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3353  hypothetical protein  58.82 
 
 
120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2433  hypothetical protein  52.94 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204851  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1885  transcriptional regulator, Fis family  49.59 
 
 
127 aa  120  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000161722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2131  hypothetical protein  42.74 
 
 
122 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0738021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  42.98 
 
 
121 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0253  hypothetical protein  38.79 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000900018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  38.84 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0317  hypothetical protein  36.97 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000156434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1712  hypothetical protein  37.39 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.20509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2023  hypothetical protein  45.88 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  37.19 
 
 
130 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  33.91 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  31.09 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0737  hypothetical protein  36.21 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  39.24 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1216  hypothetical protein  37.4 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00354732  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  32.8 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  26.96 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2639  Protein of unknown function DUF2089  34.43 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0595  uncharacterized protein-like protein  26.5 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000255916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0580  hypothetical protein  26.5 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.440494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0120  hypothetical protein  25.41 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000405426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  33.94 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  33.03 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  32.11 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>