29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3353 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3353  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4061  hypothetical protein  92.5 
 
 		 120 aa  228  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2433  hypothetical protein  64.71 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3223  hypothetical protein  58.82 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00178123  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1885  transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000161722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0253  hypothetical protein  43.36 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000900018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2131  hypothetical protein  44.92 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0738021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  40.16 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1712  hypothetical protein  35.34 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.20509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2023  hypothetical protein  48.84 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  37.07 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0317  hypothetical protein  32.5 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000156434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  34.78 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  43.59 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0737  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1216  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00354732  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  31.03 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0120  hypothetical protein  29.27 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000405426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2639  Protein of unknown function DUF2089  37.5 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  35.9 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0595  uncharacterized protein-like protein  27.97 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000255916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0580  hypothetical protein  27.97 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.440494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  34.51 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>