29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1712 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1712  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.20509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  48.7 
 
 
121 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  47.06 
 
 
125 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0253  hypothetical protein  47.97 
 
 
122 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000900018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2131  hypothetical protein  48.76 
 
 
122 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0738021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  47.5 
 
 
129 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  46.77 
 
 
136 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  41.38 
 
 
128 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1216  hypothetical protein  42.28 
 
 
131 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00354732  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  40.98 
 
 
130 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  36.44 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  44.23 
 
 
118 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4061  hypothetical protein  37.07 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0317  hypothetical protein  38.6 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000156434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3353  hypothetical protein  35.34 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3223  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00178123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2639  Protein of unknown function DUF2089  37.8 
 
 
135 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2023  hypothetical protein  42.35 
 
 
98 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2433  hypothetical protein  38.26 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204851  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1885  transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000161722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  40.74 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0120  hypothetical protein  36.29 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000405426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  33.62 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0595  uncharacterized protein-like protein  31.67 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000255916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0580  hypothetical protein  31.67 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.440494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  32.14 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>