13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0500 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.158797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1605  hypothetical protein  55.43 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.955331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0863  hypothetical protein  51.06 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  46.43 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0588  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0802661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_528  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  41.18 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0563  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000981013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  40.74 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>