14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1605 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1605  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  197  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.955331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0500  hypothetical protein  55.43 
 
 
97 aa  118  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.158797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0863  hypothetical protein  56.52 
 
 
102 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2520  hypothetical protein  39.62 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0109083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0120  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000405426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1086  hypothetical protein  38.3 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000641342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0332  hypothetical protein  43.18 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00335254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2419  hypothetical protein  32 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000248035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0235  hypothetical protein  25.93 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0029  hypothetical protein  29.87 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00652665  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0873  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06870  uncharacterized consrved protein, containing Zn finger  38.1 
 
 
125 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0371  hypothetical protein  34.67 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.376139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>