29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0271 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  153  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0046  regulatory protein; transcriptional regulator  45.95 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000520081  hitchhiker  0.00206151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2987  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.36915 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  33.87 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 181 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 106 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  30.3 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 108 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>