More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1189 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1189  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.845253  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0302  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.89 
 
 
190 aa  279  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.312661  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0663  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.26 
 
 
190 aa  267  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662012  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0457  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.84 
 
 
195 aa  263  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1989  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.59 
 
 
195 aa  260  8.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.706467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1080  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.53 
 
 
190 aa  251  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.306256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.79 
 
 
195 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.26 
 
 
195 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.72 
 
 
202 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.26 
 
 
195 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.68 
 
 
195 aa  208  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.32 
 
 
195 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.72 
 
 
195 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.26 
 
 
195 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.06 
 
 
197 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.66 
 
 
202 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.19 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.66 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.06 
 
 
196 aa  197  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.13 
 
 
198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.6 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.6 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
195 aa  195  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.6 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
195 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
195 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.41 
 
 
194 aa  193  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.94 
 
 
200 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
203 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.47 
 
 
195 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
200 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
199 aa  191  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.2 
 
 
194 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.94 
 
 
202 aa  190  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
196 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
209 aa  187  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
198 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
236 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.15 
 
 
208 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.21 
 
 
198 aa  185  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  185  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
203 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
203 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.4 
 
 
197 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.62 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.92 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.34 
 
 
198 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
198 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
197 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.21 
 
 
195 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.4 
 
 
199 aa  180  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
197 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.4 
 
 
197 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.12 
 
 
206 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.94 
 
 
197 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1331  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
202 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.73 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.27 
 
 
195 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.5 
 
 
209 aa  178  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0754  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.73 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0107  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
197 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
207 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.8 
 
 
195 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.62 
 
 
209 aa  177  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.4 
 
 
197 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
195 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
197 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.94 
 
 
197 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.2 
 
 
195 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.87 
 
 
197 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.34 
 
 
201 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.66 
 
 
194 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.52 
 
 
195 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.66 
 
 
194 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.34 
 
 
195 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.56 
 
 
195 aa  175  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.34 
 
 
195 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.34 
 
 
195 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.99 
 
 
206 aa  174  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143401  normal  0.108014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0314  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.13 
 
 
194 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
213 aa  174  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.21 
 
 
197 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1255  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.52 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0499296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.74 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1310  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.62 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.52 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.81 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.15 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.4 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  44.68 
 
 
204 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.28 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>