49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0847 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0847  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0362  putative cytochrome c-type heme-binding periplasmic protein  32.58 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1513  hypothetical protein  28.89 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.684087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0292  putative cytochrome C-type haem-binding periplasmic protein  25.65 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1143  hypothetical protein  31.29 
 
 		 532 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0240878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  32.68 
 
 		 389 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1458  trimethylamine N-oxide reductase, cytochrome c-type subunit  25.28 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  27.71 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  27.81 
 
 		 545 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1120  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  25.49 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  28 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2045  putative membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  26.34 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.729809  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  34.48 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  34.48 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0431  hypothetical protein  27.23 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  25.32 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  24.68 
 
 		 385 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.55 
 
 		 366 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  29.55 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  24.5 
 
 		 364 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1398  putative cytochrome C-type haem-binding periplasmic protein  21.15 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  24.68 
 
 		 364 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0390  putative cytochrome C-type haem-binding periplasmic protein  25 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.164119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25 
 
 		 392 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  26.32 
 
 		 392 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.35 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  27.27 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  26.14 
 
 		 368 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  23.6 
 
 		 392 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  26.09 
 
 		 392 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003826  cytochrome c-type protein TorY  25.97 
 
 		 383 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  22.28 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  22.98 
 
 		 392 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  25.3 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  23.87 
 
 		 391 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>