40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0710 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  68.89 
 
 
90 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  57.45 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  55.32 
 
 
94 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  55.32 
 
 
95 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  54.26 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  54.26 
 
 
95 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  54.26 
 
 
95 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  55.32 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  58.57 
 
 
71 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  54.93 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  60.87 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  55.81 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  46.03 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  46.03 
 
 
93 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  55 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  41.54 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  38.81 
 
 
95 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6497  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268864  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  45.45 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  42.55 
 
 
89 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>