37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3579 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  90.43 
 
 		 94 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  77.66 
 
 		 94 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  76.6 
 
 		 95 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  76.6 
 
 		 95 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  79.12 
 
 		 95 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  76.6 
 
 		 95 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  56.38 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  47.87 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  56.92 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  55.56 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  49.33 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  51.47 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  43.96 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  50.75 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  50.75 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  51.67 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  48.48 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  47.14 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  54.72 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  49.28 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  38.03 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  54.9 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  54.9 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  54.35 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  57.14 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6497  hypothetical protein  47.73 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>