41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1394 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  78.16 
 
 
95 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  60.56 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  62.32 
 
 
93 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  66.07 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  48.65 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  53.7 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  47.3 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  45.95 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  45.95 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  45.95 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  44.29 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  58.82 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  58.82 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  65 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  62.5 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  52.94 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  54.55 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  41.54 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  53.7 
 
 
90 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  51.16 
 
 
94 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  46 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6497  hypothetical protein  45.61 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268864  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  35.56 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  45.24 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4923  hypothetical protein  45 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  45.59 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  34.29 
 
 
91 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  34.29 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  42.19 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  42.19 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  42.19 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>