16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6497 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6497  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4923  hypothetical protein  87.95 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  55.56 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  55.56 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  45.61 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  47.37 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  40.82 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  46.43 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  53.66 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  42.55 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  52.27 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  47.73 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  41.82 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  47.73 
 
 		 94 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>