66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5983 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  97.4 
 
 		 93 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  77.42 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  67.02 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  67.02 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  65.96 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  47.87 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  47.3 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  44.59 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  44.59 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  44.59 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  43.24 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  57.14 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  50.94 
 
 		 73 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  47.83 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  57.14 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  60.78 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  60.78 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  64.29 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  39.76 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  65 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  38.55 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  48.28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  48.28 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  50.91 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  50.91 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  50.91 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  50.91 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6497  hypothetical protein  44.29 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  47.37 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  36.08 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  49.09 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4923  hypothetical protein  43.84 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  44.64 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1187  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  39.66 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  55 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  42.59 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  42.59 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  40.74 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  41.54 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  52.5 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>