27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4982 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  176  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  84.27 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  59.77 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  53.25 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  51.19 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  48.81 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  48.81 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  51.35 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  50.65 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  48.05 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  56.9 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  53.12 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  46.75 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  46.75 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  53.45 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  66.67 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  41.43 
 
 
90 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  43.64 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  37.68 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>