22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4558 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  77.19 
 
 		 114 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  77.19 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  77.19 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  78.95 
 
 		 114 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  92.98 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  42.11 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3493  hypothetical protein  46.49 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.486582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  43.02 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  38.26 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  38.26 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  50.65 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  60.42 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  33.62 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  37.08 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  35.56 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  44.93 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3004  hypothetical protein  39.19 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615381  normal  0.23204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>