27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5083 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  92.98 
 
 
114 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  78.07 
 
 
114 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  78.07 
 
 
122 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  78.07 
 
 
122 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  79.82 
 
 
114 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  40.35 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3493  hypothetical protein  46.49 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.486582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  41.67 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  44.19 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  40.71 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  43.02 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  40.71 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  50.65 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  47.14 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  62.79 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  33.62 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  37.08 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  36.26 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  34.44 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1648  hypothetical protein  64.71 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  41.77 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1841  hypothetical protein  64.71 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1023  hypothetical protein  64.71 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1109  hypothetical protein  64.71 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0874  hypothetical protein  64.71 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0594  hypothetical protein  64.71 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>