17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0020 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  73.68 
 
 
89 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  91.89 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  57.35 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  59.32 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  42.53 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  57.63 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  57.63 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  79.41 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  50.65 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  50.79 
 
 
114 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  59.52 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  42.55 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>