32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5117 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  98.25 
 
 
122 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  98.25 
 
 
122 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  85.09 
 
 
114 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  78.07 
 
 
114 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  42.61 
 
 
113 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  42.48 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  37.72 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3493  hypothetical protein  40.35 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.486582 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  39.13 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  43.68 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  48.05 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  71.79 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  34.83 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  34.44 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  33.05 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  34.07 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3004  hypothetical protein  39.19 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615381  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  33.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1648  hypothetical protein  55.88 
 
 
71 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  43.64 
 
 
90 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>