23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1195 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  45.22 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  42.61 
 
 
114 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  41.74 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  41.74 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  56.72 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  39.13 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  57.35 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  40.87 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  37.82 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  64.44 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  35.59 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  35.59 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  39.78 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  38.38 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  37 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  35.59 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  40.21 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  38.54 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  38 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  35.9 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4601  hypothetical protein  76 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>