28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4386 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4386  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0467  hypothetical protein  44.9 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5162  hypothetical protein  44.55 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3205  hypothetical protein  44.55 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5117  hypothetical protein  42.48 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0374  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1195  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2718  hypothetical protein  42.61 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1105  hypothetical protein  42.61 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2871  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4558  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560948  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0020  hypothetical protein  42.53 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4982  hypothetical protein  57.38 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0427305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1669  hypothetical protein  72.5 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5083  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  33.9 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  36.96 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  39.22 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  35.09 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  32.14 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  35.09 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  35.09 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  31.62 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  31.9 
 
 
113 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  39.13 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  34.74 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>