36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4681 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4681  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0834532  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3682  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484124  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3840  hypothetical protein  97.89 
 
 
95 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.788381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2428  hypothetical protein  93.68 
 
 
95 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6175  hypothetical protein  91.49 
 
 
94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5423  hypothetical protein  72.34 
 
 
94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0935727  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3579  hypothetical protein  76.6 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107998  normal  0.132957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0710  hypothetical protein  54.26 
 
 
90 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842436  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4391  hypothetical protein  52.13 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1026  hypothetical protein  55.56 
 
 
71 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1178  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0404  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0008  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0028  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1437  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.452846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1522  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1378  hypothetical protein  46.81 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3837  hypothetical protein  45.78 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.917022  normal  0.838647 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6178  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5983  hypothetical protein  44.59 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667618  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3685  hypothetical protein  50.79 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649687  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4678  hypothetical protein  50.79 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353223  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5739  hypothetical protein  44.59 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380293  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2425  hypothetical protein  46.03 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5956  hypothetical protein  47.46 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0409215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1394  hypothetical protein  45.95 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0346066  normal  0.134447 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6287  hypothetical protein  48.33 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5201  hypothetical protein  49.25 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  39.44 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  39.44 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7000  hypothetical protein  40.85 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0784  hypothetical protein  45.1 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1265  hypothetical protein  45.1 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4385  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.856404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1237  hypothetical protein  43.48 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241771  normal  0.149747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4408  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>